Intramolekulare Wasserstoffbrücken in Aminosäuren.

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(Struktur1 mit Wasserstoffbruecke) (Struktur2 mit Wasserstoffbruecke) Delta-Aminopentansäure bildet insgesamt acht Konformere mit O-H···N Wasserstoffbrücken, also vier Enantiomerenpaare. Die Stärke der Wasserstoffbrückenbindung ist dabei sehr unterschiedlich. Ähnlich wie in 5-Aminopentanol und delta-Hydroxypentansäure, aber im Gegensatz zu vielen anderen Systemen geben die verschiedenen Kriterien für die Stärke von Wasserstoffbrückenbindungen (N···H Abstand; Zunahme der O-H-Länge; Abnahme der O-H-Schwingungsfrequenz; Abweichung des N···H-O-Winkels von der Linearität; Elektronendichte der Wasserstoffbrückenbindung; Hartree-Fock-Energien, mit oder ohne Korrektur für die Nullpunktsschwingung) keine enheitliche, sondern insgesamt drei verschiedene Reihungen. Der Vergleich mit den entsprechenden Werten für Addukte von Propionsäure und Ethylamin H_3C-CH_2-COOH···NH_2-CH_2-CH_3, in denen die COOH-Groppe ebenfalls in cis-Orientation gehalten wurde, zeigt dass der achtgliedrige Ring in delta-Aminopentansäure praktisch ringspannungsfrei ist.

(Struktur3 mit Wasserstoffbruecke) (Struktur4 mit Wasserstoffbruecke) So wie in beta-Alanin und GABA gibt es Reaktionen zwischen diesen Konformeren, die die Wasserstoffbrücke intakt halten. Es zeigt sich, dass es in diesem Fall für jedes Konformer mit N···H-O Wasserstoffbrücke drei verschiedene Reaktionswege gibt. Daraus ergibt sich die folgende interessante Progression für die Anzahl der Konformere und Reaktionswege mit N···H-O Brücke in der Reihe der omega-Aminosäuren.

 Verbindung               Konformere      nichtäquivalente wasser-
                                          stoffbrückenerhaltende  
                                          Reaktionen pro Konformer
 Glycin                     1                       -             
 beta-Alanin                2                       1             
 gamma-Aminobuttersäure     4                       2             
 delta-Aminopentansäure     8                       3             


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